Là où, dans les années 1960, les excavatrices déblayaient rapidement le terrain pour le viabiliser, toutes les fouilles sont aujourd'hui menées selon des règles scientifiques strictes: chaque fois que des fouilles sont effectuées sur le site d'Augusta Raurica, des équipes de professionnels veillent à ce que toutes les découvertes et structures soient soigneusement mises au jour, documentées et conservées. De plus, on s'efforce aujourd'hui d'éviter les fouilles afin de laisser aux générations futures la possibilité d'aborder des questions qui ne sont peut-être pas encore pertinentes aujourd'hui.